RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	OLFM2	O95897	454 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	C1QC	P02747	245 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK1A1	P48729	337 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	GZMK	P49863	264 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	BTG2	P78543	158 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	RIN1	Q13671	783 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	ESCO2	Q56NI9	601 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	UCN3	Q969E3	161 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	LYRM4	Q9HD34	91 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FGF21	Q9NSA1	209 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SSX4	O60224	188 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO24	O75426	580 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN15	O95858	294 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINA2	P20848	420 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PPA1	Q15181	289 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	APH1B	Q8WW43	257 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR2A14	Q96R47	310 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	MICU1	Q9BPX6	476 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	EMC7	Q9NPA0	242 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NEK1-208	ENST00000512193	OR5K3	A6NET4	321 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SPI1	P17947	270 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN6	P56747	220 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF7	P61962	342 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ARL6IP1	Q15041	203 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CD276	Q5ZPR3	534 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C12orf73	Q69YU5	71 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FAM57B	Q71RH2	274 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A18	Q96N87	628 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SFXN2	Q96NB2	322 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		7.4	□□□□□ -1.23
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NEK1-208	ENST00000512193	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GGT3P	A6NGU5	568 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		A6NLC8	198 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DSCR3	O14972	297 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ICMT	O60725	284 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ALX3	O95076	343 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC2A1	P11166	492 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ETV6	P41212	452 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MC2R	Q01718	297 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LPAL2	Q16609	132 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZTK2	550 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PHYHIP	Q92561	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SPTSSA	Q969W0	71 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	HRH4	Q9H3N8	390 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
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NEK1-208	ENST00000512193	FADS1	O60427	444 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJB6	O75190	326 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZFAND5	O76080	213 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IGHG1	P01857	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TUBG1	P23258	451 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CD1C	P29017	333 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	THBS2	P35442	1172 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DIO1	P49895	249 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PER3	P56645	1201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF611	Q8N823	705 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		7.39	□□□□□ -1.23

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