RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509802.1

FRAS1-205, Transcript of Fraser extracellular matrix complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene FRAS1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAS1-205ENST00000509802 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OR2A2Q6IF42 318 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CASP12Q6UXS9 341 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OR2T33Q8NG76 320 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SMPDL3BQ92485 455 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 WNT2BQ93097 391 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 DDIT4LQ96D03 193 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CCL19Q99731 98 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 MED18Q9BUE0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OR52D1Q9H346 318 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 FN3KQ9H479 309 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 FANCFQ9NPI8 374 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SCOCQ9UIL1 159 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 DKKL1Q9UK85 242 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 H7C1Q1 480 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CDC42EP2O14613 210 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 IMPA2O14732 288 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 ARPC3O15145 178 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 DNPH1O43598 174 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 IDH3BO43837 385 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 PIP5K1CO60331 668 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OR7A10O76100 309 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 NDUFB2O95178 105 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 LY6G6DO95868 133 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CPN1P15169 458 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 GABRB1P18505 474 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 FUT1P19526 365 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SLC6A6P31641 620 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 GPR4P46093 362 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 EFNB1P98172 346 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 MYBPC1Q00872 1141 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CD47Q08722 323 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 FOXF2Q12947 444 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 CDK5R2Q13319 367 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 TMED1Q13445 227 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OCLNQ16625 522 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 OAFQ86UD1 273 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 LNX2Q8N448 690 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SCAIQ8N9R8 606 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 PFN4Q8NHR9 129 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 RNF217Q8TC41 542 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 FANK1Q8TC84 345 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 PERPQ96FX8 193 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 Q96MF0 132 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SFXN2Q96NB2 322 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 GPA33Q99795 319 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 PIGQQ9BRB3 760 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 UBQLN3Q9H347 655 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 DSN1Q9H410 356 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 NANSQ9NR45 359 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 BATF3Q9NR55 127 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 SCN3BQ9NY72 215 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 JKAMPQ9P055 326 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 MED11Q9P086 117 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.68□□□□□ -1.34
FRAS1-205ENST00000509802 A0A087WXM4 84 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms