RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MED17Q9NVC6 651 aa6.63□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 FLNCQ14315 2725 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 A0A1W2PQD3 144 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 OR6C68A6NDL8 312 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 H3BNH8 94 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 AGR2O95994 175 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 PTNP21246 168 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SFTPDP35247 375 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CRISP3P54108 245 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CASP6P55212 293 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CLDN18P56856 261 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CDK6Q00534 326 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SKP2Q13309 424 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SCARB2Q14108 478 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 IL13RA2Q14627 380 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 QPRTQ15274 297 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 UCK2Q9BZX2 261 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 DOCK7Q96N67 2140 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 M0QX08 132 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 TNFSF11O14788 317 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 BCKDKO14874 412 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 CLDN1O95832 211 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 TGM6O95932 706 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBE2B-204ENST00000504431 DMTNQ08495 405 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 FADDQ13158 208 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MAPRE2Q15555 327 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 SERPINA11Q86U17 422 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CADM2Q8N3J6 435 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 RNF148Q8N7C7 305 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-204ENST00000504431 NAXEQ8NCW5 288 aa6.61□□□□□ -1.35
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