RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495129.2

RPL23AP54-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP54, Length 419 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP54-201ENST00000495129 TIMM29Q9BSF4 260 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPXQ9BT56 116 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 TMEM117Q9H0C3 514 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GBA3Q9H227 469 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 RBKSQ9H477 322 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC17A5Q9NRA2 495 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 EXD2Q9NVH0 621 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GIN1Q9NXP7 522 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SVILO95425 2214 aa0.56□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 A0A0U1RQV1 116 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 LGALS9O00182 355 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 BTN3A3O00478 584 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 BCHEP06276 602 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 MMP11P24347 488 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CCND2P30279 289 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SOX6P35712 828 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 TGFBR1P36897 503 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CCR8P51685 355 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PDZK1IP1Q13113 114 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLD1Q13393 1074 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 AQP6Q13520 282 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 MESDQ14696 234 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OXA1LQ15070 435 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CEBPEQ15744 281 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 POU2AF1Q16633 256 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GGTA1PQ4G0N0 100 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 FAM78AQ5JUQ0 283 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPINT4Q6UDR6 99 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 LINC00173Q6ZV60 143 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 UTS2BQ765I0 119 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 ABHD13Q7L211 337 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PEX26Q7Z412 305 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SNX32Q86XE0 403 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 MREGQ8N565 214 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 FNDC5Q8NAU1 212 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 NEURL3Q96EH8 262 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OXGR1Q96P68 337 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CAMK2N2Q96S95 79 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF382Q96SR6 550 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 KCNK16Q96T55 309 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GPA33Q99795 319 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GABARAPL3Q9BY60 117 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 DPH5Q9H2P9 285 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 MEAF6Q9HAF1 191 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 UGT1A7Q9HAW7 530 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 UGT1A10Q9HAW8 530 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 UGT1A8Q9HAW9 530 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 LY9Q9HBG7 655 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 KLHL28Q9NXS3 571 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 IL36GQ9NZH8 169 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CHMP2BQ9UQN3 213 aa0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 TRIP11Q15643 1979 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 A0A1B0GVI7 797 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 F8WDY8 70 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 BPY2O14599 106 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OR1F1O43749 312 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 NEBLO76041 1014 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 YIF1AO95070 293 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 AP2A1O95782 977 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 MBD3O95983 291 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OPN1MWP04001 364 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OR56A5P0C7T3 313 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OPN1MW2P0DN77 364 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 OPN1MW3P0DN78 364 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 IL10P22301 178 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 TNFSF9P41273 254 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CXCL12P48061 93 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 NPBWR2P48146 333 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 CSNK1A1P48729 337 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC11A1P49279 550 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 RPS21P63220 83 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 AP1B1Q10567 949 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 GINS1Q14691 196 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC15A2Q16348 729 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC10A5Q5PT55 438 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 HCP5Q6MZN7 132 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 SASS6Q6UVJ0 657 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF493Q6ZR52 646 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLA2G4DQ86XP0 818 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 PIANPQ8IYJ0 282 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 HDDC3Q8N4P3 179 aa0.54□□□□□ -2.32
RPL23AP54-201ENST00000495129 LRRC52Q8N7C0 313 aa0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.3 ms