RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484483.1

PTP4A2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 2

Gene PTP4A2, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-205	ENST00000484483	FFAR1	O14842	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	CASK	O14936	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	FZD7	O75084	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	CH25H	O95992	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ADA	P00813	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	BGLAP	P02818	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	IFNW1	P05000	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF43	P17038	809 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	EDNRA	P25101	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	GRPR	P30550	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	SSTR2	P30874	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR3A2	P47893	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	SCAND1	P57086	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	IL13RA1	P78552	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	P2RY6	Q15077	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF74	Q16587	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PYURF	Q96I23	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	CENPE	Q02224	2701 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTP4A2-205	ENST00000484483	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483		J3KTA2	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PLPP3	O14495	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARPC2	O15144	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	GYG2	O15488	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CTAG2	O75638	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRSS23	O95084	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR6A2	O95222	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MT-ND1	P03886	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PPP3CB	P16298	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ITGA2	P17301	1181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RHCE	P18577	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	FUT1	P19526	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	PTN	P21246	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	AHCY	P23526	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	CD83	Q01151	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	MS4A2	Q01362	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ROM1	Q03395	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	TLE4	Q04727	773 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZP4	Q12836	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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