RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CMAHPQ9Y471 501 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MED12Q93074 2177 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WV48 116 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS37A4D1T9 235 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 LIPT2A6NK58 231 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 F8A1P23610 371 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SHC1P29353 583 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GRPRP30550 384 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PHF19Q5T6S3 580 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 HBMQ6B0K9 141 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 CADM3Q8N126 398 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SETD6Q8TBK2 473 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 M1APQ8TC57 530 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 METTL21AQ8WXB1 218 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM234Q8WY98 164 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PHYHIPQ92561 330 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GHSRQ92847 366 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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