RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	OR1D4	P47884	311 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	COL19A1	Q14993	1142 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	PRR22	Q8IZ63	422 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL15	Q96M94	604 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	CHRD	Q9H2X0	955 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ETV7	Q9Y603	341 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF217	O75362	1048 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	PEX14	O75381	377 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	KRT33A	O76009	404 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	REN	P00797	406 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	BGLAP	P02818	100 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H2AB	P04908	130 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SYP	P08247	313 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	EGR3	Q06889	387 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	LYPD8	Q6UX82	237 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB119	Q8N690	84 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	MIB2	Q96AX9	1013 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	HAVCR1	Q96D42	359 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT9	Q9BW91	350 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GVI7	797 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	EFNA3	P52797	238 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	AP3S2	P59780	193 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	DMWD	Q09019	674 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	LUZP2	Q86TE4	346 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	BEST4	Q8NFU0	473 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	MVB12A	Q96EY5	273 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GTH9	108 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	METTL12	A8MUP2	240 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF254	O75437	659 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF432	O94892	652 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SDHB	P21912	280 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SOX2	P48431	317 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	DCAF7	P61962	342 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	NSMAF	Q92636	917 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	INTS14	Q96SY0	518 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	SYT4	Q9H2B2	425 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	NPTN	Q9Y639	398 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQD3	144 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	HSPB2	A8KAH6	182 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	HCRTR2	O43614	444 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TSPAN2	O60636	221 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	HPX	P02790	462 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RAF1	P04049	648 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	P2RX1	P51575	399 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ART1	P52961	327 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	HSPB2	Q16082	182 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	KLK11	Q9UBX7	282 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM212	A6NML5	194 aa		15.33	■□□□□ 0.04

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