RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXO45P0C2W1 286 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFI30P13284 250 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCKP27707 260 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRK5P34947 590 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC1A3P43003 542 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MASP1P48740 699 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC9A3P48764 834 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAS1P54826 345 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF117Q03924 483 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIGFQ07326 219 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FHL1Q13642 323 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGGHGQ32M88 737 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYT14P1Q58G82 188 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBLN3Q6UW01 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM156Q8N614 296 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2T33Q8NG76 320 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR5W2Q8NH69 310 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM163Q8TC26 289 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FCGR1BQ92637 280 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMCO6Q96DC7 493 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNK17Q96T54 332 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COPS4Q9BT78 406 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEX12Q9BXU0 123 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBQLN3Q9H347 655 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HHATLQ9HCP6 504 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0R129 80 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BHLHE40O14503 412 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SURF4O15260 269 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPRIN2O60269 458 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUSD5O60279 629 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGCP20142 388 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THBS2P35442 1172 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P2RX1P51575 399 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEDD8Q15843 81 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNAPC1Q16533 368 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NTRK2Q16620 822 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DESI1Q6ICB0 168 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AHSA2Q719I0 299 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MARCH3Q86UD3 253 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CADM2Q8N3J6 435 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LNX2Q8N448 690 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GATSQ8NAP1 163 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FANK1Q8TC84 345 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NTNG2Q96CW9 530 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SGTBQ96EQ0 304 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAMD8Q96LT4 415 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR52D1Q9H346 318 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FN3KQ9H479 309 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNT8Q9NY28 637 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.49□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.48□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IRGMA1A4Y4 181 aa8.48□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNTNA6NMZ2 147 aa8.48□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRODHO43272 600 aa8.48□□□□□ -1.05
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HCRTR2O43614 444 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms