RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 TXNDC15Q96J42 360 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 EMC6Q9BV81 110 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 GASTP01350 101 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 CD14P08571 375 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ITGA5P08648 1049 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 PGA4P0DJD7 388 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 PGA3P0DJD8 388 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 PPP3CBP16298 524 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 MPGP29372 298 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RPL27P61353 136 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 FAPQ12884 760 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 STK11Q15831 433 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 GPR137CQ8N3F9 429 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 OR5K1Q8NHB7 308 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF566Q969W8 418 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 BOD1Q96IK1 185 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 OR52D1Q9H346 318 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 NRIP3Q9NQ35 241 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BNX3 289 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 UPK3AO75631 287 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 KRT33AO76009 404 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 IGHG1P01857 330 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 NR2C1P13056 603 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 APEHP13798 732 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ANXA8P13928 327 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ACADSP16219 412 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC6A6P31641 620 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RPL4P36578 427 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TGFBR3Q03167 851 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 COX10Q12887 443 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 CAMK2DQ13557 499 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RFX4Q33E94 735 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 GPR139Q6DWJ6 353 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SSX8Q7RTT4 187 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM122BQ7Z309 247 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 IGFN1Q86VF2 1251 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SVOPLQ8N434 492 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF519Q8TB69 540 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 FNDC8Q8TC99 324 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 LRTOMTQ8WZ04 291 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM54Q969K7 222 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TSPAN32Q96QS1 320 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 FEVQ99581 238 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 KATNB1Q9BVA0 655 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 IL20Q9NYY1 176 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 CDH10Q9Y6N8 788 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 FLNCQ14315 2725 aa13.43□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 A6NIZ1 184 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ENTPD5O75356 428 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 LYZL6O75951 148 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 COX6B1P14854 86 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 IL32P24001 234 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 SDHAP31040 664 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 CSNK1A1P48729 337 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RPS6KA3P51812 740 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RAP1BP61224 184 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 RAP1AP62834 184 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 HIST3H3Q16695 136 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 HMBOX1Q6NT76 420 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 LINGO2Q7L985 606 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 WDFY1Q8IWB7 410 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.42□□□□□ -0.26
ACTBP8-201ENST00000403258 OR52L1Q8NGH7 329 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms