RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384227.1

RNU6-1201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1201P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DPYSL2Q16555 572 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF699Q32M78 642 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PARP15Q460N3 678 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MPV17L2Q567V2 206 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PDZD11Q5EBL8 140 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCDC158Q5M9N0 1113 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LDLRAP1Q5SW96 308 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GPR139Q6DWJ6 353 aa-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LINC00469Q8N7U9 141 aa-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 SEC22AQ96IW7 307 aa-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 TIMM17AQ99595 171 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC25A23Q9BV35 468 aa-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 NTMT1Q9BV86 223 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C20orf85Q9H1P6 137 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PORCNQ9H237 461 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF302Q9NR11 478 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MBD2Q9UBB5 411 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 VPS28Q9UK41 221 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 ATP10DQ9P241 1426 aa-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 OPN1MWP04001 364 aa-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 OPN1MW3P0DN78 364 aa-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 AKR1B1P15121 316 aa-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 NTF3P20783 257 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PAICSP22234 425 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SSTR5P35346 364 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR1G1P47890 313 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CASP9P55211 416 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CRADDP78560 199 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BTN1A1Q13410 526 aa-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 CASP8Q14790 479 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
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RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRIM16LQ309B1 348 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ORMDL2Q53FV1 153 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ACSBG2Q5FVE4 666 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC39A4Q6P5W5 647 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FAM131AQ6UXB0 335 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C16orf62Q7Z3J2 963 aa-0.44□□□□□ -2.48
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