RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PSD2Q9BQI7 771 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 KLHL13Q9P2N7 655 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 FOCADQ5VW36 1801 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PEX14O75381 377 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PPICP45877 212 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 VEGFCP49767 419 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 SGCZQ96LD1 299 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 TRIP11Q15643 1979 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 H0YIG0 161 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 GLULP15104 373 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 WNT3P56703 355 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 CMTM1Q8IZ96 169 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 C17orf50Q8WW18 174 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 CAMK2AQ9UQM7 478 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 SRMP19623 302 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 GFERP55789 205 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 HYAL1Q12794 435 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 STK11Q15831 433 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 KCNJ8Q15842 424 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PRR18Q8N4B5 295 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 HMGCLL1Q8TB92 370 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 H7C2Y5 167 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF10AO00220 468 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 RAC2P15153 192 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 RHNO1Q9BSD3 238 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 IRF2P14316 349 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 CD46P15529 392 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 RPL27P61353 136 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 ZNF695Q8IW36 515 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A19Q9HC21 320 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 IDSB3KWA1 339 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 MSX1P28360 303 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 CASP6P55212 293 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 TNK1Q13470 666 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 MPEG1Q2M385 716 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 OR6F1Q8NGZ6 308 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 LIN7BQ9HAP6 207 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 GABRG2P18507 467 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 RNF165Q6ZSG1 346 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 NT5CQ8TCD5 201 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 NDUFB11Q9NX14 153 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PAPLNO95428 1278 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 GCH1P30793 250 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 TGFBR1P36897 503 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 C1orf53Q5VUE5 145 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 MKXQ8IYA7 352 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 ACOXLQ9NUZ1 547 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 M0R082 166 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 CPEP16870 476 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 PRDM7Q9NQW5 492 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-201ENST00000345716 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 TRIM64CA6NLI5 447 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 FUCA1P04066 466 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 OR8U9P0C7N5 309 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 HCCSP53701 268 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 SIAH3Q8IW03 269 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 OR51D1Q8NGF3 324 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 FNDC9Q8TBE3 224 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 STT3BQ8TCJ2 826 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 PIGQQ9BRB3 760 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 SLC38A1Q9H2H9 487 aa19.02■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 AKR7A3O95154 331 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 BPNT1O95861 308 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 F10P00742 488 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 SSTR2P30874 369 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 CAMLGP49069 296 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 CAV2P51636 162 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 IHHQ14623 411 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 MLC1Q15049 377 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 RHEBQ15382 184 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 RTL6Q6ICC9 239 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 DCXRQ7Z4W1 244 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 SULF2Q8IWU5 870 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 TMEM59Q9BXS4 323 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-201ENST00000345716 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms