RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326298.8

CCNC-201, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCNC, Length 2,212 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-201ENST00000326298 BIDP55957 195 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PUDPQ08623 228 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PMS2P3Q13401 168 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 EFNB3Q15768 340 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 FAM91A1Q658Y4 838 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 CGB2Q6NT52 195 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SPATA21Q7Z572 469 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 UEVLDQ8IX04 471 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SKA3Q8IX90 412 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 DPP10Q8N608 796 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 C10orf53Q8N6V4 93 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SPATA3Q8NHX4 192 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 B9A039 149 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ADRA2AP08913 450 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 FAM157CP0CG43 387 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ADORA3P0DMS8 318 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ZNF35P13682 527 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 DSCR9P59020 149 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ERVS71-1P61550 626 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ZNF74Q16587 644 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 CYP51A1Q16850 503 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ZNF813Q6ZN06 617 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 KRT73Q86Y46 540 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NUP37Q8NFH4 326 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 DYDC1Q8WWB3 177 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PROX1Q92786 737 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 TSPAN32Q96QS1 320 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SH3GL3Q99963 347 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SYT3Q9BQG1 590 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SLC7A7Q9UM01 511 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 A0A0G2JND7 137 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 EVPLLA8MZ36 301 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 LMX1BO60663 402 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 STAMBPO95630 424 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 HPXP02790 462 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 DAOP14920 347 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NPR2P20594 1047 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NR4A1P22736 598 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ALDH3B1P43353 468 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PDLIM4P50479 330 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 MYBPC1Q00872 1141 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 DAG1Q14118 895 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 RAB39AQ14964 217 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 OR5J2Q8NH18 312 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PFN4Q8NHR9 129 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ZNF607Q96SK3 696 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 BEX2Q9BXY8 128 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 OR51B6Q9H340 312 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NANOGQ9H9S0 305 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 CHP2O43745 196 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NCR1O76036 304 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 F13BP05160 661 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 COL8A2P25067 703 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 ARR3P36575 388 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 OR1E2P47887 323 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 PPOXP50336 477 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NCALDP61601 193 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 RAB1AP62820 205 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 NFYCQ13952 458 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 GSG1Q2KHT4 349 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNC-201ENST00000326298 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms