RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262210.9

CSPP1-201, Transcript of centrosome and spindle pole associated protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSPP1, Length 4,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1-201ENST00000262210 DEF8Q6ZN54 512 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 OR8K3Q8NH51 312 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ISOC1Q96CN7 298 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 FOPNLQ96NB1 174 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 CITED4Q96RK1 184 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 NLNQ9BYT8 704 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 HPF1Q9NWY4 346 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ING4Q9UNL4 249 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 SERINC4A6NH21 518 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 B3GALT2O43825 422 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 SBK2P0C263 348 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ATP6V1B1P15313 513 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ZNF23P17027 643 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 STK11Q15831 433 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 SPATS1Q496A3 300 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 RDH10Q8IZV5 341 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 LINC00471Q8N535 108 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 Q96M85 177 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 KCNK17Q96T54 332 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 TM9SF2Q99805 663 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 NIPAL2Q9H841 368 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 WDR54Q9H977 334 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 C12orf10Q9HB07 376 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 PRODH2Q9UF12 536 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 V9GYH0 126 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 CR1P17927 2039 aa4.59□□□□□ -1.67
CSPP1-201ENST00000262210 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SLC28A2O43868 658 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 OR7A10O76100 309 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 YES1P07947 543 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 FPR1P21462 350 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 GSTM2P28161 218 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 DDOSTP39656 456 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 KEAP1Q14145 624 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 NIPAL3Q6P499 406 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 ABHD13Q7L211 337 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 LNX2Q8N448 690 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SCMH1Q96GD3 660 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 TPK1Q9H3S4 243 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 MED17Q9NVC6 651 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 IFT52Q9Y366 437 aa4.59□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 CCNKO75909 580 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 PTHLHP12272 177 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 CDAP32320 146 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 AQP2P41181 271 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 ITGADQ13349 1161 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 KLHL35Q6PF15 583 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 SLC7A6Q92536 515 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 FBXO17Q96EF6 278 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 EMC6Q9BV81 110 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 C3orf18Q9UK00 162 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CSPP1-201ENST00000262210 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms