RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 WDR76Q9H967 626 aa21.63■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 COMMD3Q9UBI1 195 aa21.63■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 PISDQ9UG56 409 aa21.63■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 H3BML4 177 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 AKR7A3O95154 331 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 IGHMP01871 453 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TFPIP10646 304 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 IMPDH2P12268 514 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 EDNRAP25101 427 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ZMAT1Q5H9K5 638 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 PXKQ7Z7A4 578 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CDC20BQ86Y33 519 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 MINDY2Q8NBR6 621 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 NXPE2Q96DL1 559 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CDCP1Q9H5V8 836 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CPNE5Q9HCH3 593 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 B9D1Q9UPM9 204 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TRAPPC4Q9Y296 219 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 MELKQ14680 651 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF79Q15937 498 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC58Q4VC31 144 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FOXK1P85037 733 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 PUDPQ08623 228 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 MFSD13AQ14CX5 517 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OPN5Q6U736 354 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 DIRAS2Q96HU8 199 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TAAR9Q96RI9 348 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 C14orf119Q9NWQ9 140 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TCN2P20062 427 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ZP4Q12836 540 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 POC5Q8NA72 575 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OR5M1Q8NGP8 315 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OR6N2Q8NGY6 317 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SNX18Q96RF0 628 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC32Q9BV29 185 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 POTEKPQ9BYX7 375 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TCFL5Q9UL49 500 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FKBP7Q9Y680 259 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 IGHEP01854 428 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 RPS27P42677 84 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 MAP2K6P52564 334 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FADS6Q8N9I5 356 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SCAIQ8N9R8 606 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CT55Q8WUE5 264 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FOXN4Q96NZ1 517 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 INTS14Q96SY0 518 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ZPBPQ9BS86 351 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A1W2PQ72 361 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 LIPT2A6NK58 231 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC16A7O60669 478 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CD1AP06126 327 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 JMJD7P0C870 316 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OR8G3PP0DMU2 310 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SNTA1Q13424 505 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM131AQ6UXB0 335 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 DPY19L4Q7Z388 723 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OR4K17Q8NGC6 315 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 KLHL15Q96M94 604 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FRMD6Q96NE9 622 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CHST11Q9NPF2 352 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 LAMP5Q9UJQ1 280 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 HPGDSO60760 199 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 DLGAP3O95886 979 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SERPINA3P01011 423 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OPN1LWP04000 364 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 PSKH1P11801 424 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 MYL9P24844 172 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OTX2P32243 289 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SSR4P51571 173 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OTPQ5XKR4 325 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 OR8H2Q8N162 312 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TEX19Q8NA77 164 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SRRQ9GZT4 340 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 SERINC1Q9NRX5 453 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 RHBDL2Q9NX52 303 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ALPK2Q86TB3 2170 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A1W2PPK0 400 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FUOMA2VDF0 154 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 FABP12A6NFH5 140 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CD63P08962 238 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 CTLA4P16410 223 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 ALOX5APP20292 161 aa21.58■■□□□ 1.05
TSPAN13-201ENST00000262067 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms