RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 NHLRC1Q6VVB1 395 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF11O14788 317 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ACVR1BP36896 505 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM109AQ8N4B1 249 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TM9SF4Q92544 642 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRG7Q96K78 797 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YC42 278 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ENP7 123 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT7O00154 380 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DNPH1O43598 174 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 GYPBP06028 91 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 STARP49675 285 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A1P53007 311 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 HSF1Q00613 529 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RNLSQ5VYX0 342 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCK1Q86TW2 530 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 GHDCQ8N2G8 530 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 EXD3Q8N9H8 876 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 MUL1Q969V5 352 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX18Q96RF0 628 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBA1CQ9BQE3 449 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 HAO2Q9NYQ3 351 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 APC2O95996 2303 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC14L5O43304 696 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF9O43307 516 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB36O95755 333 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNGR1P15260 489 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK2P20151 261 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DCKP27707 260 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GLCTQ6Y288 498 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35D2Q76EJ3 337 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB10Q8WXI3 467 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 OXGR1Q96P68 337 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A15Q9H2J7 730 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB6Q9NWX5 421 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 NOX1Q9Y5S8 564 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP295Q9C0D2 2601 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 XKRYO14609 159 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 APOL3O95236 402 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SPI1P17947 270 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTT1P30711 240 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN15P56746 228 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RAC3P60763 192 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS7P62081 194 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MELKQ14680 651 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB39AQ14964 217 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A1Q14973 349 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35D3Q5M8T2 416 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM225Q6GV28 225 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TRILQ7L0X0 811 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RASD1Q9Y272 281 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPA5E9PKD4 350 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 H7C1C5 153 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 J3QRE1 110 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RAMP1O60894 148 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL10O95999 233 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RENP00797 406 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX2P50458 406 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A1P53985 500 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LCN6P62502 163 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS3BPQ08380 585 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2UQ5VVX9 321 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 HBMQ6B0K9 141 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 BORAQ6PGQ7 559 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SHFQ7M4L6 423 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 UEVLDQ8IX04 471 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4F15Q8NGB8 312 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2V1Q8NHB1 315 aa22.26■■□□□ 1.15
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