RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589759.1

ATP6V0A1-223, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 3

Gene ATP6V0A1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CORO2A	Q92828	525 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	STAC	Q99469	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPR21	Q99679	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CDC6	Q99741	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RGCC	Q9H4X1	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		A0A087WWC5	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		A6NIZ1	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		J3KTA2	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DVL2	O14641	736 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SIAH2	O43255	324 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	XRCC3	O43542	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LDB2	O43679	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TCF21	O43680	179 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR1F1	O43749	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	B4GALT3	O60512	393 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CA11	O75493	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR2C1	O95371	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SOX14	O95416	240 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MMP3	P08254	477 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NR2F1	P10589	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AKR1A1	P14550	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FABP4	P15090	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CD46	P15529	392 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATF1	P18846	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GSTM3	P21266	225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAOA	P21397	527 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SDHB	P21912	280 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NME2	P22392	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CD82	P27701	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ITPKB	P27987	946 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ADH6	P28332	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AKT2	P31751	481 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TTPA	P49638	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UCP2	P55851	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CLDN12	P56749	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TAS2R43	P59537	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TAS2R19	P59542	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAX	P61244	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CAPS	Q13938	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF234	Q14588	700 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	INSL4	Q14641	139 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TGIF1	Q15583	401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PTPRN	Q16849	979 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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