RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 PUDPQ08623 228 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.76□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.76□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 CDK20Q8IZL9 346 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 OR2T29Q8NH02 315 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 PFN4Q8NHR9 129 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.76□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.76□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.76□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.75□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 FAM27E3Q08E93 113 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 OR10A4Q9H209 315 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.75□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 SH3D21A4FU49 640 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 DPPA5A6NC42 116 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CENPBD1B2RD01 187 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 LRRN3E7EW58 273 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 TNFRSF11BO00300 401 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CASKO14936 926 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 KLF4O43474 513 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 PIP5K1CO60331 668 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ZNF432O94892 652 aa8.74□□□□□ -1.01
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GGA3-209ENST00000580646 GOSR1O95249 250 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ADORA3P0DMS8 318 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 FCGR1AP12314 374 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 MAKP20794 623 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 FPR3P25089 353 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 CD79BP40259 229 aa8.74□□□□□ -1.01
GGA3-209ENST00000580646 ART1P52961 327 aa8.74□□□□□ -1.01
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