RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	OR51B6	Q9H340	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SP140L	Q9H930	580 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PARVB	Q9HBI1	364 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GPR173	Q9NS66	373 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DEC1	Q9P2X7	70 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431		A8MUA0	341 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRN3	E7EW58	273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SGK494	L7N484	410 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	BMPR1B	O00238	502 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FBP2	O00757	339 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SDHD	O14521	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RS1	O15537	224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NEBL	O76041	1014 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	H6PD	O95479	791 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TSPAN12	O95859	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	WDPCP	O95876	746 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CST1	P01037	141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KRT7	P08729	469 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	F5	P12259	2224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	UCHL3	P15374	230 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CYP11B1	P15538	503 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CBR1	P16152	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GABRG2	P18507	467 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CD22	P20273	847 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PRDX2	P32119	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	HSD17B3	P37058	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ACTR1B	P42025	376 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RANBP1	P43487	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC6A8	P48029	635 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SERPINB8	P50452	374 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DLX5	P56178	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CLDN18	P56856	261 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	REEP5	Q00765	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MYBPC1	Q00872	1141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIP10	Q15642	601 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	STX1A	Q16623	288 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CA9	Q16790	459 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	WDR38	Q5JTN6	314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM215	Q68D42	235 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	STH	Q8IWL8	128 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TEX26	Q8N6G2	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	HSD17B8	Q92506	261 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NRGN	Q92686	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CERS2	Q96G23	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SERPINB11	Q96P15	392 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NODAL	Q96S42	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NDN	Q99608	321 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GABRG3	Q99928	467 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	HINT2	Q9BX68	163 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LHX5	Q9H2C1	402 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431		Q9N2K0	584 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SCML1	Q9UN30	329 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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