RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	P2RY6	Q15077	328 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	MICA	Q29983	383 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZBED5	Q49AG3	693 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM123	Q8N131	208 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	INIP	Q9NRY2	104 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	AP4S1	Q9Y587	144 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	CLOCK	O15516	846 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTP4A3	O75365	173 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TIPRL	O75663	272 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SERPINI2	O75830	405 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	F13B	P05160	661 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCKAR	P32238	428 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	UGT2B10	P36537	528 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	PEX19	P40855	299 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	GSS	P48637	474 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	IST1	P53990	364 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ALG10	Q5BKT4	473 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A1W2PRG6	482 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC35F4	A4IF30	521 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	UNC119B	A6NIH7	251 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	C16orf97	H3BN30	126 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	PDLIM1	O00151	329 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	GNGT2	O14610	69 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC43A1	O75387	559 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADA	P00813	363 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	COX5A	P20674	150 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRPS1	P60891	318 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR6X1	Q8NH79	312 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	EMC6	Q9BV81	110 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	NTN4	Q9HB63	628 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ASB6	Q9NWX5	421 aa		18.92	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL8A1	P27658	744 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	BID	P55957	195 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	LGALS3BP	Q08380	585 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSPAN31	Q12999	210 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ITGAD	Q13349	1161 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATP6AP1	Q15904	470 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACKR1	Q16570	336 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	UPB1	Q9UBR1	384 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	HCFC1	P51610	2035 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF726	A6NNF4	738 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	UPK3A	O75631	287 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	BCL10	O95999	233 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	GAST	P01350	101 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	IGHM	P01871	453 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	IGHV1-2	P23083	117 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	FXYD6P3	P58550	94 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAP	Q12884	760 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	LRR1	Q96L50	414 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR10A4	Q9H209	315 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		18.9	■□□□□ 0.62
SDR39U1-208	ENST00000554698	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	E2F6	O75461	281 aa		18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	NDUFB2	O95178	105 aa		18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	FCGR1A	P12314	374 aa		18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	MELK	Q14680	651 aa		18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	TAF11	Q15544	211 aa		18.89	■□□□□ 0.61
SDR39U1-208	ENST00000554698	LINGO2	Q7L985	606 aa		18.89	■□□□□ 0.61

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