RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	NRBF2	Q96F24	287 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CIB1	Q99828	191 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	JKAMP	Q9P055	326 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HSPB2	A8KAH6	182 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107		G3V2T6	193 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	DLGAP1	O14490	977 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	UPK3A	O75631	287 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	PPP1R3D	O95685	299 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HIST1H2AB	P04908	130 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	FCGR2A	P12318	317 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	BID	P55957	195 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	PER3	P56645	1201 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	IL1RL1	Q01638	556 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	1e-11	■■□□□ 13.9
MATR3-238	ENST00000512107	HSPB2	Q16082	182 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ACKR1	Q16570	336 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	RFX4	Q33E94	735 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ALG10	Q5BKT4	473 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CARD17	Q5XLA6	110 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	UEVLD	Q8IX04	471 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CDK20	Q8IZL9	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM123	Q8N131	208 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ASB10	Q8WXI3	467 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM45B	Q96B21	275 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	RASD2	Q96D21	266 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107		Q96M85	177 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	OR2M2	Q96R28	347 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	INIP	Q9NRY2	104 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HCFC1	P51610	2035 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	PTPN13	Q12923	2485 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	C19orf84	I3L1E1	186 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	EI24	O14681	340 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	MGRN1	O60291	552 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ADA	P00813	363 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF43	P17038	809 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	PEX2	P28328	305 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CAMK2D	Q13557	499 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	GK3P	Q14409	553 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TSC22D1	Q15714	1073 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	OR2A2	Q6IF42	318 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	NIPAL3	Q6P499	406 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CBR4	Q8N4T8	237 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	STMN2	Q93045	179 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107		E9PQ18	207 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107		H7C1C5	153 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	BHLHE40	O14503	412 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	NDUFB2	O95178	105 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	VAMP5	O95183	116 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	OR6A2	O95222	327 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	SLC2A10	O95528	541 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	IL18BP	O95998	194 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MATR3-238	ENST00000512107	IGHM	P01871	453 aa		12.85	□□□□□ -0.35

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