RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 ZNF382Q96SR6 550 aa5.07□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NPAS1Q99742 590 aa5.07□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CDH20Q9HBT6 801 aa5.07□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.07□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 DUX4Q9UBX2 424 aa5.07□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.07□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 LRRC30A6NM36 301 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 VGLL3A8MV65 326 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 SH3BGRLO75368 114 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 SERPINA5P05154 406 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 GUSBP08236 651 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 KRT16P08779 473 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 IVDP26440 423 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NPRL3Q12980 569 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 IQCB1Q15051 598 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 QPRTQ15274 297 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 TEX35Q5T0J7 233 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PDZD9Q8IXQ8 264 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ERGIC1Q969X5 290 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 DDIT4LQ96D03 193 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CHRM4P08173 479 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 AHCYP23526 432 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CRATP43155 626 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 UBE2E1P51965 193 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 TRADDQ15628 312 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 C18orf15Q96N68 181 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 DERL2Q9GZP9 239 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CACNG2Q9Y698 323 aa5.06□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 HERC1Q15751 4861 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 A0A1W2PS29 197 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 C9JVG2 144 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 H3BUX3 64 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 GLRA3O75311 464 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CRCPO75575 148 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NUDT14O95848 222 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MAGEA6P43360 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CCNG1P51959 295 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 OR2B6P58173 313 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ATP6V0D1P61421 351 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 LTB4RQ15722 352 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ACSM6Q6P461 480 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 GRINAQ7Z429 371 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MYDGFQ969H8 173 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 LRR1Q96L50 414 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ZNF583Q96ND8 569 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 STACQ99469 402 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 K7EPI3 171 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 DYNLT3P51808 116 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 RBBP4Q09028 425 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 KLHL26Q53HC5 615 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 VRK2Q86Y07 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 CNGA4Q8IV77 575 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 SCAIQ8N9R8 606 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 MECRQ9BV79 373 aa5.05□□□□□ -1.6
CDH18-210ENST00000511273 TRIM5Q9C035 493 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms