RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFNA21	P01568	189 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARAF	P10398	606 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAK	P20794	623 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITPKB	P27987	946 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMEL	P40967	661 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	H2BFS	P57053	126 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAS2R31	P59538	309 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAAA	Q02083	359 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HAGH	Q16775	308 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSD17B8	Q92506	261 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMG2	Q969U7	264 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAAR9	Q96RI9	348 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KXD1	Q9BQD3	176 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ETV7	Q9Y603	341 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF212B	A8MTL3	300 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RCBTB2	O95199	551 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV2-5	P01817	119 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8U9	P0C7N5	309 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIPC	P11150	499 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A4	P12235	298 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	RHOQ	P17081	205 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	EPHA1	P21709	976 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD200	P41217	278 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	P2RX1	P51575	399 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERINC3	Q13530	473 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KHDC3L	Q587J8	217 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CMBL	Q96DG6	245 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPATA33	Q96N06	139 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFS8	O00217	210 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRP3	O75074	770 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	B3GALT4	O96024	378 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD37	P11049	281 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATF1	P18846	271 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSR1	P21757	451 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNT3	P56703	355 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAS2R20	P59543	309 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEF2D	Q14814	521 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DRAM2	Q6UX65	266 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf111	Q8N326	155 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHST4	Q8NCG5	386 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KATNBL1	Q9H079	304 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARV1	Q9H2C2	271 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAP1	O75689	374 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8G	P07360	202 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTSL	P07711	333 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SFTPB	P07988	381 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TACSTD2	P09758	323 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNLIPRP1	P54315	467 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDK5	Q00535	292 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSPAN31	Q12999	210 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE1	Q13065	139 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGIF1	Q15583	401 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXO32	Q969P5	355 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM19	Q96HH6	336 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD180	Q99467	661 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TXN2	Q99757	166 aa		7.55	□□□□□ -1.2

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