RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OR2M2Q96R28 347 aa15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 POMPQ9Y244 141 aa15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.95■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC35F4A4IF30 521 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF726A6NNF4 738 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 C11orf98E9PRG8 122 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RNF13O43567 381 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 PIP5K1CO60331 668 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CTAG2O75638 210 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RAP2AP10114 183 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CRYGSP22914 178 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 LAPTM4AQ15012 233 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM123Q8N131 208 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OR6X1Q8NH79 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 S100PBPQ96BU1 408 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TXNDC15Q96J42 360 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.94■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 LYZL6O75951 148 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 KRT33AO76009 404 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 THBDP07204 575 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ITGA5P08648 1049 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 IFNGR1P15260 489 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OMPP47874 163 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CBX1P83916 185 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 FHL1Q13642 323 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TAF11Q15544 211 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 GABRA6Q16445 453 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 FGD3Q5JSP0 725 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OAFQ86UD1 273 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 INIPQ9NRY2 104 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RASSF1Q9NS23 344 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC7A8Q9UHI5 535 aa15.93■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CIB4A0PJX0 185 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OR5H1A6NKK0 313 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CENPBD1B2RD01 187 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 EBAG9O00559 213 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 PTP4A3O75365 173 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 UPK3AO75631 287 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 BCL10O95999 233 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SAGP10523 405 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 RRM2P31350 389 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 AQP2P41181 271 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 LIMS1P48059 325 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 PRPS1P60891 318 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SPIBQ01892 262 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 FLOT2Q14254 428 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SEC23BQ15437 767 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TSC22D1Q15714 1073 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 C20orf196Q8IYI0 205 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ADGRG5Q8IZF4 528 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 LINC00471Q8N535 108 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 OR52J3Q8NH60 311 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 EMC6Q9BV81 110 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 MED29Q9NX70 200 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.92■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ITPR2Q14571 2701 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A1W2PRG6 482 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 KLF4O43474 513 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 PAX7P23759 505 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 IFNGR2P38484 337 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 GK3PQ14409 553 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 TAB1Q15750 504 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 STK11Q15831 433 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ZBED5Q49AG3 693 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 ASRGL1Q7L266 308 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 CANT1Q8WVQ1 401 aa15.91■□□□□ 0.14
CNKSR1-208ENST00000484874 MUCL1Q96DR8 90 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms