RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	IFI30	P13284	250 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PTN	P21246	168 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOP	P49908	381 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	NR1H2	P55055	460 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A2	Q01362	244 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FAP	Q12884	760 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GK3P	Q14409	553 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	NRM	Q8IXM6	262 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM123	Q8N131	208 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	KDM8	Q8N371	416 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OR6X1	Q8NH79	312 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MUCL1	Q96DR8	90 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MUS81	Q96NY9	551 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	RHCG	Q9UBD6	479 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MAST4	O15021	2626 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRG6	482 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CIB4	A0PJX0	185 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OR5H1	A6NKK0	313 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF726	A6NNF4	738 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LYZL6	O75951	148 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GADD45G	O95257	159 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-9	P01782	118 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HMGA2	P52926	109 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PRPS1	P60891	318 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	BEX5	Q5H9J7	111 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00471	Q8N535	108 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	INIP	Q9NRY2	104 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	EDAR	Q9UNE0	448 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35F4	A4IF30	521 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf98	E9PRG8	122 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	BCL10	O95999	233 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HRG	P04196	525 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	THBD	P07204	575 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	RAP2A	P10114	183 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DOB	P13765	273 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	IFNGR1	P15260	489 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SPIB	Q01892	262 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PPA1	Q15181	289 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	TAB1	Q15750	504 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GABRA6	Q16445	453 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FGD3	Q5JSP0	725 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	OAF	Q86UD1	273 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	LURAP1	Q96LR2	239 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241		V9GYQ6	96 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	GSC2	O15499	205 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	KLF4	O43474	513 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	PIP5K1C	O60331	668 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ENTPD5	O75356	428 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	RAD51D	O75771	328 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	IGHM	P01871	453 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	NR2C1	P13056	603 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	MAK	P20794	623 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	HOXC12	P31275	282 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	IFNGR2	P38484	337 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	FLOT2	Q14254	428 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PTPA-222	ENST00000445241	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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