RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYRM1O43325 122 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKAR1AP10644 381 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPXP11678 715 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATF1P18846 271 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXA6P31267 233 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGCBQ16585 318 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A19Q695T7 634 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRINAQ7Z429 371 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC20BQ86Y33 519 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRG3Q86Y34 549 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF121Q9H920 327 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0C4DFX4 3053 aa16.94■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TVP23AA6NH52 213 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf98E9PRG8 122 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFPL1O95159 310 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC2P0DI81 140 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC2BP0DI82 140 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITPNBP48739 271 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-BQ31612 363 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHYHIPQ92561 330 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RARRES3Q9UL19 164 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MVM7 634 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF879B4DU55 563 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF9O43307 516 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALOX12BO75342 701 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TACSTD2P09758 323 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKCAP17252 672 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXD12P35452 270 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPP1P49441 399 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC26A5P58743 744 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFR3AQ14156 821 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTX3Q8N9I9 347 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5H6Q8NGV6 325 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSD17B8Q92506 261 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRMD6Q96NE9 622 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOX4Q9NPH5 578 aa16.93■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0B4J293 547 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GVC2 190 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMX3A6NHT5 357 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A6NIN4 97 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FZD7O75084 574 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPK3AO75631 287 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM157BP0CG42 384 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDOSTP39656 456 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXW4P57775 412 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLET1Q6UQ28 207 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MISPQ8IVT2 679 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP18Q8NEJ0 188 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP76Q8TAP6 659 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST6GAL2Q96JF0 529 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WACQ9BTA9 647 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUSD2Q9UGT4 822 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XKRYO14609 159 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIN1P1O15428 100 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKR7A3O95154 331 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD16AO95870 558 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTT2P0CG29 244 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTT2BP0CG30 244 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSKH1P11801 424 aa16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFITM2Q01629 132 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms