RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 OAFQ86UD1 273 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 OR2T29Q8NH02 315 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 OR6X1Q8NH79 312 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 MARVELD3Q96A59 401 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C14orf79Q96F83 325 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 BOD1Q96IK1 185 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 REEP1Q9H902 201 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 INIPQ9NRY2 104 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 AURKCQ9UQB9 309 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.43□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SH3D21A4FU49 640 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C11orf98E9PRG8 122 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TNFRSF11BO00300 401 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 KRT33AO76009 404 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 BCL10O95999 233 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 HLA-DOBP13765 273 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 IFNGR1P15260 489 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV1-2P23083 117 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 IL32P24001 234 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 EDNRAP25101 427 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 MPGP29372 298 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CCKARP32238 428 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 AQP2P41181 271 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 DAP3P51398 398 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FAPQ12884 760 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 STK11Q15831 433 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ZBED5Q49AG3 693 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ALG10Q5BKT4 473 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM123Q8N131 208 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 HSD17B8Q92506 261 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 OR2M2Q96R28 347 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.42□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 COL12A1Q99715 3063 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SLC35F4A4IF30 521 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CDC42EP2O14613 210 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CASKO14936 926 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CLOCKO15516 846 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 KLF4O43474 513 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 OR10H3O60404 316 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 PTP4A3O75365 173 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV3-9P01782 118 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 PAX7P23759 505 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FPR3P25089 353 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SSTR2P30874 369 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 GPR4P46093 362 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FHL1Q13642 323 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 LAPTM4AQ15012 233 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 MICAQ29983 383 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 OR51A7Q8NH64 312 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 LINC01560Q8TB33 94 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TXNDC15Q96J42 360 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 MUS81Q96NY9 551 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 MED18Q9BUE0 208 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 MED29Q9NX70 200 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CIB4A0PJX0 185 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 UNC119BA6NIH7 251 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 GNGT2O14610 69 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 FKBP6O75344 327 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 UPK3AO75631 287 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CCNB2O95067 398 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 CST1P01037 141 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 IGHMP01871 453 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-210ENST00000423693 NR2C1P13056 603 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms