RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 SLCO2B1O94956 709 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 YIF1AO95070 293 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SPTBP11277 2137 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 RSU1Q15404 277 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ACBD4Q8NC06 268 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 NUP43Q8NFH3 380 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF559Q9BR84 538 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 MRI1Q9BV20 369 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 KATNBL1Q9H079 304 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 FKRPQ9H9S5 495 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 KCNE3Q9Y6H6 103 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1B0GV50 99 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 BTBD17A6NE02 478 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 NUDT19A8MXV4 375 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 LSSP48449 732 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 S100A10P60903 97 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 AGERQ15109 404 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 IRF4Q15306 451 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 RNF44Q7L0R7 432 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CHST4Q8NCG5 386 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 OR56A1Q8NGH5 318 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 MYADMQ96S97 322 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 KXD1Q9BQD3 176 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CMC2Q9NRP2 79 aa11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 GPRIN2O60269 458 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 B4GALT2O60909 372 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 IFNA2P01563 188 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 AVPR2P30518 371 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TAS2R19P59542 299 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CXADRP78310 365 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF616Q08AN1 781 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 IL10RAQ13651 578 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ACTBL2Q562R1 376 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 MRGPREQ86SM8 312 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SLC6A7Q99884 636 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 LAT2Q9GZY6 243 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 DOCK1Q14185 1865 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 COLCA2A8K830 154 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 FCMRO60667 390 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf105O95561 183 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ARG1P05089 322 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF28P17035 718 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CASP6P55212 293 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 DHRS2Q13268 280 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 FRMD1Q8N878 549 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CMTM3Q96MX0 182 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 OR7D2Q96RA2 312 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 NDUFS4O43181 175 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TSPAN15O95858 294 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 PRH1P02810 166 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SPARCP09486 303 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 SLC6A6P31641 620 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 P2RY4P51582 365 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 ARSIQ5FYB1 569 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 AVL9Q8NBF6 648 aa11.29□□□□□ -0.6
SZRD1-201ENST00000401088 FGF11Q92914 225 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms