RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGF1P05230 155 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSF3P09919 207 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 GKN3PP0CG01 181 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRB3P13945 408 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETS2P15036 469 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTCP35070 178 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 RORAP35398 523 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B2P37059 387 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 FDFT1P37268 417 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 GYG1P46976 350 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHX2P50458 406 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH4P55283 916 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC63Q05C16 580 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMARCB1Q12824 385 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGGQ5H8A4 983 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSL3PQ5NE16 218 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM40Q6P9F5 258 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDELC1Q6UW63 502 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF621Q6ZSS3 439 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf120Q7Z4R8 191 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIANPQ8IYJ0 282 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF786Q8N393 782 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPRX1Q8N7U7 411 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 VN1R2Q8NFZ6 395 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2G3Q8NGZ4 309 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARCH1Q8TCQ1 289 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCOLN3Q8TDD5 553 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSFY1Q96LI6 401 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MS4A4EQ96PG1 132 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR8B4Q96RC9 309 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SORT1Q99523 831 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD19PQ9H560 264 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 NT5MQ9NPB1 228 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF226Q9NYT6 803 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA7Q9P0W8 599 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 XCL2Q9UBD3 114 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUN2Q9UH99 717 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCYOX1Q9UHG3 505 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF639Q9UID6 485 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNPTGQ9UJJ9 305 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB26Q9ULW5 256 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPTNQ9Y639 398 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF35A5YM69 484 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX7O00628 323 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSTPIP1O43586 416 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOX15O60248 233 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGRN1O60291 552 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ICOSLGO75144 302 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUPT3HO75486 399 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPK3AO75631 287 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERLIN2O94905 339 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV3-11P04433 115 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2P06681 752 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MX1P20591 662 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNR1P21554 472 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 NMUP48645 174 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPOXP50336 477 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCR6P51684 374 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERVK_113P61574 105 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 REG3AQ06141 175 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGTLC2Q14390 218 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGCAQ16586 387 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAJINQ3KP22 176 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBED5Q49AG3 693 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD21Q4G0X4 260 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFDP3Q5H9I0 405 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf226Q5I0X4 101 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCN12Q6JVE5 192 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNIH2Q6PI25 160 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUFY3Q7L099 469 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGFL6Q8IUX8 553 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1L6Q8NGR2 347 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR13C2Q8NGS9 318 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDR42E1Q8WUS8 393 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHC3Q92529 594 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 STMN2Q93045 179 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM104AQ969W3 186 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 C12orf42Q96LP6 360 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms