RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 H3BMQ9 156 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 UPK1AO00322 258 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TCTN1Q2MV58 587 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 FCRLAQ7L513 359 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 WDR76Q9H967 626 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CRLF2Q9HC73 371 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CDHR4A6H8M9 788 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 ATG12O94817 140 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 FPR3P25089 353 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 RGS19P49795 217 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 IKZF1Q13422 519 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SLC15A4Q8N697 577 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 RAB9BQ9NP90 201 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TMEM221A6NGB7 291 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 STMND1H3BQB6 276 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 M0R296 226 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GPRIN2O60269 458 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MORN4Q8NDC4 146 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 UBE2FQ969M7 185 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LAMA4Q16363 1823 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 DOCK2Q92608 1830 aa9.8□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 A0A087WUU8 490 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LYRM1O43325 122 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 HPGDSO60760 199 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SLC34A2O95436 690 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LGI1O95970 557 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 PIGAP37287 484 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SAXO2Q658L1 398 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 COMTD1Q86VU5 262 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SARAFQ96BY9 339 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 NICN1Q9BSH3 213 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MED17Q9NVC6 651 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GNG12Q9UBI6 72 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 OPRL1P41146 370 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TAAR9Q96RI9 348 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TRIB1Q96RU8 372 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 METTL9Q9H1A3 318 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 I3L521 148 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GABRPO00591 440 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 ACOT8O14734 319 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 BET1O15155 118 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 PXKQ7Z7A4 578 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LIPHQ8WWY8 451 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 NCR1O76036 304 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MT-ATP6P00846 226 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 MSL3P1P0C860 447 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 S100A1P23297 94 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 FAPQ12884 760 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 IL10RAQ13651 578 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 GPR157Q5UAW9 335 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 NOX4Q9NPH5 578 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.79□□□□□ -0.84
TMX3-201ENST00000299608 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms