RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299338.10

FAM227B-201, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene FAM227B, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-201ENST00000299338 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.73□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 CNIH4Q9P003 139 aa14.73□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.73□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 WASF3Q9UPY6 502 aa14.73□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.73□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 MPZL2O60487 215 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SCO1O75880 301 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SCG5P05408 212 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ANXA8P13928 327 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 MST1P26927 711 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GAS1P54826 345 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ZNF613Q6PF04 617 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 LAX1Q8IWV1 398 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 NR4A3Q92570 626 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GPA33Q99795 319 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 VDAC3Q9Y277 283 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.72□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 A0A1W2PRG6 482 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 EFSO43281 561 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GPX5O75715 221 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 LYPD3O95274 346 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 IL1AP01583 271 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GABRB1P18505 474 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 P2RX1P51575 399 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 CCL11P51671 97 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 BTG1P62324 171 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 CBFBQ13951 182 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SPINK14Q6IE38 97 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ULK3Q6PHR2 472 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 COMMD7Q86VX2 200 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 OR8H3Q8N146 312 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 OR5W2Q8NH69 310 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 TMEM239Q8WW34 195 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 THAP4Q8WY91 577 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 CHP2O43745 196 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 SOX14O95416 240 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 RAF1P04049 648 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 HSMCR30P0CW71 290 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 RRASP10301 218 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 POU1F1P28069 291 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GPR4P46093 362 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 CYB561P49447 251 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GPR85P60893 370 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 C3orf49Q96BT1 292 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 GPR83Q9NYM4 423 aa14.71□□□□□ -0.05
FAM227B-201ENST00000299338 FUT1P19526 365 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 PGCP20142 388 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 DDI2Q5TDH0 399 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 MISPQ8IVT2 679 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 GPR119Q8TDV5 335 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 NPAS1Q99742 590 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 TSPAN4O14817 238 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 TSPAN19P0C672 248 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 FAM157BP0CG42 384 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 TACR3P29371 465 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 CD96P40200 585 aa14.7□□□□□ -0.06
FAM227B-201ENST00000299338 SLC6A8P48029 635 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms