RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 DOK1Q99704 481 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 VAPAQ9P0L0 249 aa16.98■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 STAMBPO95630 424 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 HPRP00739 348 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-DOBP13765 273 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 DAOP14920 347 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 THBS2P35442 1172 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 NCALDP61601 193 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 C7orf26Q96N11 449 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 EMC6Q9BV81 110 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SELENONQ9NZV5 590 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 USP22Q9UPT9 525 aa16.97■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 A0A087WUJ7 227 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM129A0AVI4 362 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 TGDSO95455 350 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 HNF1AP20823 631 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 IDH3AP50213 366 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SCARB2Q14108 478 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 DAG1Q14118 895 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 OR1Q1Q15612 314 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 KRT80Q6KB66 452 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 OR6S1Q8NH40 331 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 EPYCQ99645 322 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 EBF4Q9BQW3 602 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SOX7Q9BT81 388 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 ASPNQ9BXN1 380 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 NOX3Q9HBY0 568 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 CORINQ9Y5Q5 1042 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 GMEB1Q9Y692 573 aa16.96■□□□□ 0.31
CXCL3-201ENST00000296026 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0B4J2E0 115 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GX12 115 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 LRP5LA4QPB2 252 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 HLA-HP01893 362 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 BGLAPP02818 100 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 SLC6A2P23975 617 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 GIFP27352 417 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 AQP1P29972 269 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ADRM1Q16186 407 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 CDK20Q8IZL9 346 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 SCAIQ8N9R8 606 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 TXNDC15Q96J42 360 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 LRR1Q96L50 414 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF607Q96SK3 696 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 WFDC6Q9BQY6 131 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 MED29Q9NX70 200 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.95■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 TPST2O60704 377 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 CD79AP11912 226 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 GPX2P18283 190 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 PIGFQ07326 219 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 PMS2P3Q13401 168 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 GSG1Q2KHT4 349 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF786Q8N393 782 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 CMAHPQ9Y471 501 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.94■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF726A6NNF4 738 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 EVPLLA8MZ36 301 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 LRRN3E7EW58 273 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 LILRA1O75019 489 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ERLIN1O75477 346 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 SERPINB7O75635 380 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 ADRA2AP08913 450 aa16.93■□□□□ 0.3
CXCL3-201ENST00000296026 TACSTD2P09758 323 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms