RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291547.9

PKNOX1-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX1, Length 5,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1-201ENST00000291547 CLMPQ9H6B4 373 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF98A6NK75 572 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 CLDN1O95832 211 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 F13BP05160 661 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 CCR6P51684 374 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 BAXQ07812 192 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ASAH1Q13510 395 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 LCTLQ6UWM7 567 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR2T11Q8NH01 316 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR8U1Q8NH10 309 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ST8SIA2Q92186 375 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM106AQ96A25 262 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TGM5O43548 720 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 HLA-HP01893 362 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 PFKMP08237 780 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 FOLR1P15328 257 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TACR3P29371 465 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 RAB13P51153 203 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SIRPAP78324 504 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 AKR1C1Q04828 323 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 RNLSQ5VYX0 342 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 FRMD1Q8N878 549 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TANKQ92844 425 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 MYADMQ96S97 322 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 MED20Q9H944 212 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM72A0PK05 275 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 LINC00862A6NCI5 91 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR5K3A6NET4 321 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 CYB5BO43169 146 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 GASTP01350 101 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 EDN1P05305 212 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 HTR2CP28335 458 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 IMPA1P29218 277 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 CLDN10P78369 228 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM57BQ71RH2 274 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 NAA40Q86UY6 237 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 MFSD4AQ8N468 514 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 GHRLQ9UBU3 117 aa9.97□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 RNF212BA8MTL3 300 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 LEUTXA8MZ59 168 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SGK494L7N484 410 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SCG5P05408 212 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR13C7P0DN81 318 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF28P17035 718 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 DAPP51397 102 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 HBA1P69905 142 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 IFITM2Q01629 132 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF266Q14584 549 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 FOXJ1Q92949 421 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 OR7D2Q96RA2 312 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 TPPP3Q9BW30 176 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ANGPTL7O43827 346 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 KCNK5O95279 499 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 RAF1P04049 648 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 CHRNB4P30926 498 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 WNT7BP56706 349 aa9.96□□□□□ -0.81
PKNOX1-201ENST00000291547 KCNJ10P78508 379 aa9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms