RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SLC16A7O60669 478 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SFTPDP35247 375 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CTSCP53634 463 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CST6Q15828 149 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GMLQ99445 158 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 DUSP21Q9H596 190 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CSF3P09919 207 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SPI1P17947 270 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PRLHRP49683 370 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 RADILQ96JH8 1075 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ARNTP27540 789 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 DPPA4Q7L190 304 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 DTD2Q96FN9 168 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.46□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 LRP5LA4QPB2 252 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 EDIL3O43854 480 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GPR137BO60478 399 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 MAKP20794 623 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 RAB3CQ96E17 227 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR10A5Q9H207 317 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR10A2Q9H208 303 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 USP3Q9Y6I4 520 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GLTPD2A6NH11 291 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 HTR2CP28335 458 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR5B2Q96R09 309 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 HHATLQ9HCP6 504 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 C17orf105B2RV13 164 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 NFKBIEO00221 500 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GABARAPH6UMI1 98 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 BDH1Q02338 343 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TLE4Q04727 773 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR7A5Q15622 319 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 Q499Y3 187 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CEP250Q9BV73 2442 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FZD9O00144 591 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 MSTNO14793 375 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PMP2P02689 132 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZNF74Q16587 644 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 21.5
TTL-201ENST00000233336 GPR34Q9UPC5 381 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 LGALS8O00214 317 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 YKT6O15498 198 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 HBE1P02100 147 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PSMB5P28074 263 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ARRB2P32121 409 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 DGCR2P98153 550 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ARID2Q68CP9 1835 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CA12O43570 354 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR13C7P0DN81 318 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ITGB7P26010 798 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 SLC19A1P41440 591 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CTF1Q16619 201 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CLDN20P56880 219 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 ZNF596Q8TC21 504 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 YIPF5Q969M3 257 aa9.45□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 CFIP05156 583 aa9.44□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.44□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TTL-201ENST00000233336 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms