RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055006.11

Trim16-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim16, Length 3,906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16-201ENSMUST00000055006 ShhQ62226 437 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Enpp3Q6DYE8 874 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 N6amt1Q6SKR2 214 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr17Q7TRM9 315 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr309Q7TS01 308 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fbxo34Q80XI1 695 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cldn17Q8BXA6 224 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Commd2Q8BXC6 199 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 P2ry10bQ8BY68 352 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Peli1Q8C669 418 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Lyrm4Q8K215 91 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr99Q8VFE4 305 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gimap3Q99MI6 301 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tktl1Q99MX0 595 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Dusp12Q9D0T2 339 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmem41aQ9D8U2 264 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r53Q9EP93 310 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r56Q9EPS9 310 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cnot9Q9JKY0 299 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Htr6Q9R1C8 440 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Lbx2Q9WUN8 195 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cfap54Q8C6S9 3106 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cyp4a32A2A8T1 509 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr727A2RTN7 324 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 4930595D18RikD3Z642 64 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm45062E0CZ38 131 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ms4a7E9Q9V5 267 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm6576F6YTZ4 274 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 PpibP24369 216 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 MatkP41242 505 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tas2r123P59528 333 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cnn2Q08093 305 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 XkrxQ5GH68 449 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ap3s2Q8BSZ2 193 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cml2Q8CHQ9 238 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 TMEM121BQ99MX7 572 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 SelenosQ9BCZ4 190 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 RetnlaQ9EP95 111 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Yipf7Q9JIM5 254 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Naa10Q9QY36 235 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cdh23Q99PF4 3354 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Atxn7l3A2AWT3 347 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1095A3KPP7 308 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rd3lB2RV38 197 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn2r101E9PZS9 857 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm8281L7N235 204 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sstr5O08858 362 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Kcns1O35173 497 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Bnip2O54940 326 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nipsnap1O55125 284 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 NfyaP23708 346 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 AhrP30561 848 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 FahP35505 419 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ankub1Q3UUE9 192 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Bbs1Q3V3N7 593 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Otop2Q80SX5 563 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pamr1Q8BU25 720 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cep68Q8C0D9 733 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rab38Q8QZZ8 211 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr993Q8VF75 314 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1261Q8VFB0 306 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr644Q8VH21 314 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Brix1Q9DCA5 353 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Adam18Q9R157 719 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Adamts9E9PUN6 1931 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr576A0A0G2JFH3 312 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm21876F6XK35 94 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ccl26F8VQM2 93 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r168K7N6B6 309 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 MfngO09008 321 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mapk14P47811 360 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cxcl5P50228 132 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Defa14P50712 85 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Actc1P68033 377 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Acta1P68134 377 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 McptlQ00356 246 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 2410002F23RikQ3TE80 284 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 ScimpQ3UU41 150 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 LpoQ5SW46 710 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1058Q7TR74 316 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr198Q7TS40 306 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc30a8Q8BGG0 367 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Plekho2Q8K124 495 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmed4Q8R1V4 227 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr97Q8VFE1 310 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pycr1Q922W5 309 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sucnr1Q99MT6 317 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 PigkQ9CXY9 395 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Asb12Q9D738 308 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cir1Q9DA19 450 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc46a3Q9DC26 460 aa7.19□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Isyna1Q9JHU9 557 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.7 ms