Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHU9

Isyna1, Inositol-3-phosphate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isyna1Q9JHU9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Isyna1Q9JHU9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Isyna1Q9JHU9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Isyna1Q9JHU9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Isyna1Q9JHU9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Isyna1Q9JHU9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Isyna1Q9JHU9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Isyna1Q9JHU9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Isyna1Q9JHU9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Isyna1Q9JHU9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Isyna1Q9JHU9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Isyna1Q9JHU9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Isyna1Q9JHU9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Isyna1Q9JHU9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Isyna1Q9JHU9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Isyna1Q9JHU9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isyna1Q9JHU9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Isyna1Q9JHU9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Isyna1Q9JHU9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Isyna1Q9JHU9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Isyna1Q9JHU9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Isyna1Q9JHU9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Isyna1Q9JHU9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Isyna1Q9JHU9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Isyna1Q9JHU9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Isyna1Q9JHU9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Isyna1Q9JHU9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Isyna1Q9JHU9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Isyna1Q9JHU9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Isyna1Q9JHU9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Isyna1Q9JHU9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Isyna1Q9JHU9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Isyna1Q9JHU9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Isyna1Q9JHU9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Isyna1Q9JHU9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Isyna1Q9JHU9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Isyna1Q9JHU9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Isyna1Q9JHU9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Isyna1Q9JHU9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Isyna1Q9JHU9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Isyna1Q9JHU9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Isyna1Q9JHU9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Isyna1Q9JHU9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Isyna1Q9JHU9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Isyna1Q9JHU9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Isyna1Q9JHU9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Isyna1Q9JHU9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Isyna1Q9JHU9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Isyna1Q9JHU9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Isyna1Q9JHU9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Isyna1Q9JHU9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Isyna1Q9JHU9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Isyna1Q9JHU9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Isyna1Q9JHU9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Isyna1Q9JHU9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Isyna1Q9JHU9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Isyna1Q9JHU9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Isyna1Q9JHU9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Isyna1Q9JHU9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Isyna1Q9JHU9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Isyna1Q9JHU9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Isyna1Q9JHU9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Isyna1Q9JHU9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Isyna1Q9JHU9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Isyna1Q9JHU9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Isyna1Q9JHU9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Isyna1Q9JHU9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Isyna1Q9JHU9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Isyna1Q9JHU9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Isyna1Q9JHU9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Isyna1Q9JHU9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Isyna1Q9JHU9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Isyna1Q9JHU9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Isyna1Q9JHU9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Isyna1Q9JHU9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Isyna1Q9JHU9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Isyna1Q9JHU9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Isyna1Q9JHU9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Isyna1Q9JHU9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Isyna1Q9JHU9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Isyna1Q9JHU9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Isyna1Q9JHU9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Isyna1Q9JHU9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Isyna1Q9JHU9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Isyna1Q9JHU9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Isyna1Q9JHU9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Isyna1Q9JHU9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Isyna1Q9JHU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Isyna1Q9JHU9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Isyna1Q9JHU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Isyna1Q9JHU9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Isyna1Q9JHU9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Isyna1Q9JHU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Isyna1Q9JHU9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Isyna1Q9JHU9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Isyna1Q9JHU9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Isyna1Q9JHU9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Isyna1Q9JHU9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Isyna1Q9JHU9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Isyna1Q9JHU9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms