RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr430E9Q5F1 317 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r60L7N2A1 853 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htr1bP28334 386 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VegfdP97946 358 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gal3st2cQ3ULK5 396 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dcdc2Q5DU00 475 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc26a10Q5EBI0 492 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930512M02RikQ5SQK8 218 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sntb2Q61235 520 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gas6Q61592 674 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt2Q6PB93 570 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bdh1Q80XN0 343 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam30Q811Q3 732 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Edem2Q8BJT9 577 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chpt1Q8C025 398 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elf5Q8VDK3 253 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Erlec1Q8VEH8 483 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1254Q8VFB1 314 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alg2Q9DBE8 415 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sgk3Q9ERE3 496 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akirin2B1AXD8 201 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbbp9O88851 186 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TP20293 436 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr18Q0VAX9 331 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fut4Q11127 433 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss38Q3UKY7 322 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfaip3Q60769 775 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il17aQ62386 158 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1161Q7TR29 321 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrn3Q8CBC6 707 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Upp2Q8CGR7 320 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddah2Q99LD8 285 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyc1Q9D0M3 325 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptpn20O55082 426 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Camk2aP11798 478 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11bP46638 218 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap2s1P62743 142 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bahd1Q497V6 772 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifngr2Q63953 332 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc36a3Q811P0 477 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LaynQ8C351 381 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Memo1Q91VH6 297 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sfxn5Q925N0 342 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serinc1Q9QZI8 453 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syngr4Q9Z1L2 233 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5493S4R2D1 92 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2022A0A1Y7VLT7 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2075J3QMW5 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5039J3QNT6 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tp63O88898 680 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk1P11440 297 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pax4P32115 349 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crhr1P35347 415 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PitpnbP53811 271 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CbfbQ08024 187 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2016Q3TQZ4 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Parp8Q3UD82 852 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BB287469Q3UT53 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8332Q3UTA4 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Camk2dQ6PHZ2 499 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kirrel2Q7TSU7 700 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd16bQ80YU0 474 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5662Q8BX20 144 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpusd1Q8VCZ8 306 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajb11Q99KV1 358 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd8Q9CX56 353 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vstm5Q9D806 199 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rad1Q9QWZ1 280 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Naa10Q9QY36 235 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oasl2Q9Z2F2 508 aa11.84□□□□□ -0.51
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp964B2RR88 472 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r69G3XA45 850 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6fP35460 134 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SypQ62277 314 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plpp7Q91WB2 271 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnaja3Q99M87 480 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actl6bQ99MR0 426 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lancl2Q9JJK2 450 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clcf1Q9QZM3 225 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13102A2ASJ3 519 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tomm5B1AXP6 51 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r68E9Q0V3 319 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr550E9Q544 316 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf148G3X9R7 316 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phox2bO35690 314 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc35f3Q1LZI2 421 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tsr3Q5HZH2 323 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Calm5Q6W3E0 140 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp790Q80ZX2 779 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmbox1Q8BJA3 419 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp286Q8C0E6 519 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc123Q8CII2 336 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.2 ms