RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr1493-ps1A0A140LHU2 316 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tas2r122D3YU55 309 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm3542K7N6U2 270 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prdx6O08709 224 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 OtpO09113 325 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Kcns1O35173 497 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cops3O88543 423 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Camk2aP11798 478 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AcheP21836 614 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PnpP23492 289 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AcrP23578 436 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Clec10aP49300 304 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nup43P59235 380 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zdhhc2P59267 366 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ArsgQ3TYD4 525 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Obox3Q3UT54 335 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ppp5cQ60676 499 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Vat1Q62465 406 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Otop2Q80SX5 563 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Scml4Q80VG1 408 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cldn17Q8BXA6 224 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ikzf4Q8C208 586 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lyrm4Q8K215 91 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 RfesdQ8K2P6 157 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem242Q8VCR3 140 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lcn9Q9D267 178 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Obp1aQ9D3H2 163 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Plxdc2Q9DC11 530 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dgat2Q9DCV3 388 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Isyna1Q9JHU9 557 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lmx1aQ9JKU8 382 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Btbd35f23A0A0R4J2B9 498 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm5799E9Q2M1 201 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr173E9QAT7 321 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nipsnap2O55126 281 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01635 115 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sox7P40646 380 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ScimpQ3UU41 150 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klhl6Q6V595 619 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Flrt3Q8BGT1 649 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 RybpQ8CCI5 228 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rab43Q8CG50 210 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rab38Q8QZZ8 211 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Wdr45Q91VM3 360 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp810Q99K45 461 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem51Q99LG1 249 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sucnr1Q99MT6 317 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cthrc1Q9D1D6 245 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 EqtnQ9D9V2 337 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Bpnt1Q9Z0S1 308 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm9495A0A0J9YUZ3 350 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tomm5B1AXP6 51 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm15446D3Z5Y8 553 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prdm13E9PZZ1 754 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lin7bO88951 207 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01851 173 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01852 173 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 H2-Q10P01898 325 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ifi204P0DOV2 619 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccr4P51680 360 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cdk5r1P61809 307 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 St3gal2Q11204 350 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ttyh2Q3TH73 532 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ndufb6Q3UIU2 128 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lin28bQ45KJ6 247 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Xrcc1Q60596 631 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nr0b1Q61066 472 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 NnatQ61979 81 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tgfbr2Q62312 592 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Eci3Q78JN3 317 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ubfd1Q78JW9 368 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr487Q7TRU9 314 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fbxo34Q80XI1 695 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Muc20Q8BUE7 656 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nkd2Q8VE28 461 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Slc25a36Q922G0 311 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Clint1Q99KN9 631 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smim3Q99PE5 60 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ppa1Q9D819 289 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tssc4Q9JHE7 317 aa10.23□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm42372A0A1B0GT27 204 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ttc39aA2ACP1 578 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Calhm1D3Z291 348 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fpr-s1O08790 351 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zmat3O54836 290 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CtslP06797 334 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rplp0P14869 317 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gdi1P50396 447 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pou3f4P62515 361 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 DtymkP97930 212 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Serpina3mQ03734 418 aa10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50 ms