RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606426.1

CUX2P1-201, Transcript of cut like homeobox 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CUX2P1, Length 298 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2P1-201ENST00000606426 PPP3CBP16298 524 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PTNP21246 168 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OMPP47874 163 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OR3A2P47893 321 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SORDQ00796 357 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 COX10Q12887 443 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TSPAN31Q12999 210 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CCNIQ14094 377 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 P2RY6Q15077 328 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ATP6AP1Q15904 470 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 MICAQ29983 383 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZBED5Q49AG3 693 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ALG10Q5BKT4 473 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 VWA1Q6PCB0 445 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CASP12Q6UXS9 341 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SSX8Q7RTT4 187 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FNDC8Q8TC99 324 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 STMN2Q93045 179 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 LRR1Q96L50 414 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OR10A4Q9H209 315 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 INIPQ9NRY2 104 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 UPB1Q9UBR1 384 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.65□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 UNC119BA6NIH7 251 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 A6NIZ1 184 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 MCIDASD6RGH6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 PRSS44E7EML9 344 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 LRRN3E7EW58 273 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 C11orf98E9PRG8 122 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 KLF4O43474 513 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 PIP5K1CO60331 668 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 RAMP1O60894 148 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 TIPRLO75663 272 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 KRT33AO76009 404 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 NDUFB2O95178 105 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 BCL10O95999 233 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 ADAP00813 363 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 IGHG1P01857 330 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 POU2F1P14859 743 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 KLK2P20151 261 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 MAKP20794 623 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 PAX7P23759 505 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 UQCRC1P31930 480 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 CD79BP40259 229 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 AQP2P41181 271 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 GPR4P46093 362 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 GSSP48637 474 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 RPS6KA3P51812 740 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 CLDN17P56750 224 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 RAP1BP61224 184 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 RAP1AP62834 184 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 TGFBR3Q03167 851 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 SEC23BQ15437 767 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 STK11Q15831 433 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 NIPAL3Q6P499 406 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 Q6ZT83 130 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 LUZP2Q86TE4 346 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 SVOPLQ8N434 492 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX2P1-201ENST00000606426 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms