RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MLLT10P55197 1068 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 RAC3P60763 192 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 H3F3AP84243 136 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGADQ13349 1161 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2A1Q16548 175 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TBR1Q16650 682 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GGNQ86UU5 652 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SMPDL3BQ92485 455 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP14Q9NWM8 211 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA1AO00555 2505 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP7P3A6NL99 342 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 VAMP5O95183 116 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTL6AO96019 429 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CD97P48960 835 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL27P61353 136 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf57Q0VDD7 668 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TMED1Q13445 227 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF773Q6PK81 442 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CPOQ8IVL8 374 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52E2Q8NGJ4 325 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 MYDGFQ969H8 173 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 Q96M85 177 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX18Q96RF0 628 aa27.83■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 IRGMA1A4Y4 181 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGES3LE9PB15 166 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ACVR2AP27037 513 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC15A1P46059 708 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM205BPQ63HN1 556 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCK1Q86TW2 530 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM99Q8N816 258 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC37A3Q8NCC5 494 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRG7Q96K78 797 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN32Q96QS1 320 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TIGARQ9NQ88 270 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RASD1Q9Y272 281 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NOX1Q9Y5S8 564 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CLPTM1O96005 669 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CELA3AP09093 270 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF24P17028 368 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY4P51582 365 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT6P53370 316 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CRMP1Q14194 572 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 INAQ16352 499 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4K13Q8NH42 304 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFSF11O14788 317 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 DBTP11182 482 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC4Q5T2S8 1044 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 HBMQ6B0K9 141 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM225Q6GV28 225 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PLBD1Q6P4A8 553 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2V1Q8NHB1 315 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NEIL3Q8TAT5 605 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RELTQ969Z4 430 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 OXGR1Q96P68 337 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 COPS4Q9BT78 406 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX5Q9Y5X3 404 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 HTR1FP30939 366 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 LHX2P50458 406 aa27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 AHSA2Q719I0 299 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS48Q7RTY5 328 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 NPEPL1Q8NDH3 523 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SDR9C7Q8NEX9 313 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A15Q9H2J7 730 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 AMBNQ9NP70 447 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NIZ1 184 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A31A6NKX4 558 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 XKRYO14609 159 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 CARD18P57730 90 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RAP1BP61224 184 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 RAP1AP62834 184 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-206ENST00000588815 HSF1Q00613 529 aa27.78■■■□□ 2.04
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