RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556886.1

LINC00871-204, long intergenic non-protein coding RNA 871, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00871, Length 866 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00871-204ENST00000556886 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 OR7D2Q96RA2 312 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CSF3RQ99062 836 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 STACQ99469 402 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ARHGDIGQ99819 225 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 PIGUQ9H490 435 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 HMG20AQ9NP66 347 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C5AR2Q9P296 337 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 FBXW2Q9UKT8 454 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MKLN1Q9UL63 735 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SATB2Q9UPW6 733 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 TRANK1O15050 2925 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 NCOR1O75376 2440 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 A0A0G2JN53 185 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 HYKKA2RU49 373 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C4orf51C9J302 202 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CLDN25C9JDP6 229 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 TLR4O00206 839 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 FMO6PO60774 539 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 OR5F1O95221 314 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GPR75O95800 540 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ATP1B1P05026 303 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CD36P16671 472 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 AGAP20933 346 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 PSMB9P28065 219 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ALDH4A1P30038 563 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 XKP51811 444 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CASP9P55211 416 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CASP6P55212 293 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C21orf59P57076 290 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CDK5Q00535 292 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 DECR1Q16698 335 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ZNF585BQ52M93 769 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GPAT3Q53EU6 434 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C18orf63Q68DL7 685 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CASP12Q6UXS9 341 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 AHSA2Q719I0 299 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 IQCHQ86VS3 1027 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 OOSP2Q86WS3 158 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SLC43A2Q8N370 569 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MORN4Q8NDC4 146 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CADM4Q8NFZ8 388 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 FNDC8Q8TC99 324 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 TMED6Q8WW62 240 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 LGALS12Q96DT0 336 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GIMAP5Q96F15 307 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MED30Q96HR3 178 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 NRTNQ99748 197 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 TEX12Q9BXU0 123 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MMP27Q9H306 513 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 MED17Q9NVC6 651 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 OR6C74A6NCV1 312 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 OR5K3A6NET4 321 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 H0YGG7 62 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 TAF4O00268 1085 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 AP3D1O14617 1153 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00871-204ENST00000556886 CTSVO60911 334 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms