RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ABCD4	O14678	606 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	SOD3	P08294	240 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	DANCR	P0C864	163 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	LIPE	Q05469	1076 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	SSX8	Q7RTT4	187 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	PERP	Q96FX8	193 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	BOD1	Q96IK1	185 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	OR2M2	Q96R28	347 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	NELFA	Q9H3P2	528 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	BAG5	Q9UL15	447 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	CD99	P14209	185 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	FUT4	P22083	530 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	CD40	P25942	277 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	IL1RL1	Q01638	556 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	TGFBR3	Q03167	851 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	PMS2P3	Q13401	168 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	ZNF74	Q16587	644 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	PGGHG	Q32M88	737 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	DEF8	Q6ZN54	512 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	UEVLD	Q8IX04	471 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	TXNDC15	Q96J42	360 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	ASPN	Q9BXN1	380 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	MED29	Q9NX70	200 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	ZAN	Q9Y493	2812 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CS-222	ENST00000550996	GMNC	A6NCL1	334 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996		M0R1B8	84 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	KRT33A	O76009	404 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CH25H	O95992	272 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MT-ATP6	P00846	226 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	GSK3B	P49841	420 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NUDT2	P50583	147 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PUDP	Q08623	228 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996		Q5PR19	223 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	FBXW5	Q969U6	566 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MPP4	Q96JB8	637 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	EMC6	Q9BV81	110 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	GSX2	Q9BZM3	304 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SLC43A1	O75387	559 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	IFNA14	P01570	189 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PTH2R	P49190	550 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	UGT2B15	P54855	530 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CDH11	P55287	796 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	GNGT1	P63211	74 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	OR5J2	Q8NH18	312 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TPD52L3	Q96J77	140 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	GPR35	Q9HC97	309 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996		A0A096LPE4	126 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PPZ6	126 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	OVOL3	O00110	214 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	OR5F1	O95221	314 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PAX1	P15863	534 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PTAFR	P25105	342 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TAS2R41	P59536	307 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	PRPS1	P60891	318 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SELENOW	P63302	87 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TUBA1B	P68363	451 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	TUBA4A	P68366	448 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	SHE	Q5VZ18	495 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-222	ENST00000550996	CARD17	Q5XLA6	110 aa		18.24	■□□□□ 0.51

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