RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.86□□□□□ -1.15
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PTPRB-208ENST00000550358 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 RNF175Q8N4F7 328 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 CD300AQ9UGN4 299 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MSR1P21757 451 aa7.85□□□□□ -1.15
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