RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 KCT2Q8NC54 265 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PP6455Q8WZ26 134 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PTX4Q96A99 478 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 NUDT9Q9BW91 350 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 KLHL31Q9H511 634 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 BRD7Q9NPI1 651 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 C5AR2Q9P296 337 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 NUDT19A8MXV4 375 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 H3BSA7 217 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 LINC01565O15544 149 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SOX15O60248 233 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PPP1R3DO95685 299 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 IGHV4-34P06331 123 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SBK2P0C263 348 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ITGA3P26006 1051 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 DPP4P27487 766 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 RNF4P78317 190 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CDC20Q12834 499 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 DNASE1L3Q13609 305 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ZNF385BQ569K4 471 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 OR7G2Q8NG99 324 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 HYLS1Q96M11 299 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 LHPPQ9H008 270 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 RERGLQ9H628 205 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ZNF175Q9Y473 711 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 OR6C6A6NF89 314 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 A8MUA0 341 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 D6RAR5 112 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SYT7O43581 403 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 FZD7O75084 574 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CCNKO75909 580 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SLC22A5O76082 557 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PMS2P2O95744 297 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SEMG1P04279 462 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 TFAP2AP05549 437 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CRHP06850 196 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 GABRA1P14867 456 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 RAB6AP20340 208 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 MSR1P21757 451 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PYCR1P32322 319 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 MPLP40238 635 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 STARP49675 285 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 HERV-K104P61576 105 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 HLA-BQ31612 363 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 FAM69BQ5VUD6 431 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 C18orf63Q68DL7 685 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 NOXA1Q86UR1 476 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 KIF18BQ86Y91 864 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PHC2Q8IXK0 858 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 OR6T1Q8NGN1 323 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ZNF681Q96N22 645 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 DCBLD2Q96PD2 775 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 DPH1Q9BZG8 443 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 GPR27Q9NS67 375 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 A0A087WUU8 490 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PPH5 198 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 FAM172BPA6NC97 362 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 GASTP01350 101 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 AKAIN1P0CW23 69 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PSKH1P11801 424 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 COL9A1P20849 921 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 ITGB8P26012 769 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 PRSS3P35030 304 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 THBS4P35443 961 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CFHR1Q03591 330 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 CDK10Q15131 360 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 LINGO2Q7L985 606 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.35□□□□□ -1.55
POLK-215ENST00000514141 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms