RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		5.15	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		5.15	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0B4J2E0	115 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1B0GX12	115 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM247	A6NEH6	219 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SERINC4	A6NH21	518 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAMDEC1	O15204	470 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM20B	O75063	409 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ICOSLG	O75144	302 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	GMNN	O75496	209 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFAND5	O76080	213 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	DIRAS1	O95057	198 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5F1	O95221	314 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	UTS2	O95399	124 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NTN1	O95631	604 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CST1	P01037	141 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	IGF2	P01344	180 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNW1	P05000	195 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINA7	P05543	415 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TSPAN19	P0C672	248 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPA8	P0DM63	369 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	THRB	P10828	461 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ITGAM	P11215	1152 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	PRG2	P13727	222 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ITGA2	P17301	1181 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	IGFBP2	P18065	325 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CBL	P22681	906 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ALDH3A2	P51648	485 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	AQP4	P55087	323 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	MLF1	P58340	268 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	EFNB1	P98172	346 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIP10	Q15642	601 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NNAT	Q16517	81 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	DECR1	Q16698	335 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	GXYLT1	Q4G148	440 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	WLS	Q5T9L3	541 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6ZWC4	215 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	LNX2	Q8N448	690 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717		Q8TCH9	128 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	GRHL3	Q8TE85	626 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	LZIC	Q8WZA0	190 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NR4A3	Q92570	626 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	OMA1	Q96E52	524 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ARSG	Q96EG1	525 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ADO	Q96SZ5	270 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	CIB1	Q99828	191 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	BDH2	Q9BUT1	245 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717		V9GYQ6	96 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A087WUU8	490 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	LIPT2	A6NK58	231 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	C17orf51	A8MQB3	221 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	PDLIM1	O00151	329 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	MASP2	O00187	686 aa		5.13	□□□□□ -1.59
DCTN1-222	ENST00000492717	EI24	O14681	340 aa		5.13	□□□□□ -1.59

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