RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 LINC00470Q9BZP3 86 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC17A5Q9NRA2 495 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.58■■□□□ 1.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CXCR6O00574 342 aa23.57■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCD4O14678 606 aa23.57■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 SERPINI2O75830 405 aa23.57■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 OR5F1O95221 314 aa23.57■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 OR1E2P47887 323 aa23.57■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 SHEQ5VZ18 495 aa23.57■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 OR4D11Q8NGI4 311 aa23.57■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 SLC25A15Q9Y619 301 aa23.57■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa23.56■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.56■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 FKRPQ9H9S5 495 aa23.56■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 SPAG4Q9NPE6 437 aa23.56■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 C11orf98E9PRG8 122 aa23.55■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 MS4A18H0YCH9 400 aa23.55■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF13O43567 381 aa23.55■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 TNFRSF1BP20333 461 aa23.55■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 MS4A18Q3C1V0 323 aa23.55■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 OR6N1Q8NGY5 312 aa23.55■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF229Q9UJW7 825 aa23.55■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa23.54■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 B3GAT1Q9P2W7 334 aa23.54■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM239Q8WW34 195 aa23.53■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 OR2M2Q96R28 347 aa23.53■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 FNDC11Q9BVV2 318 aa23.53■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 RPS6KA6Q9UK32 745 aa23.53■■□□□ 1.36
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CCZ1B-211ENST00000486840 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 CD40P25942 277 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 LGALS3BPQ08380 585 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 TBRG1Q3YBR2 411 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 HIKESHIQ53FT3 197 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 IFI44LQ53G44 452 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR31Q8NA23 367 aa23.52■■□□□ 1.36
CCZ1B-211ENST00000486840 SGTBQ96EQ0 304 aa23.52■■□□□ 1.36
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