RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	IFNA2	P01563	188 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	IFNA21	P01568	189 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	HTR1E	P28566	365 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	CA7	P43166	264 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB11A	P62491	216 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB11B	Q15907	218 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	POLE	Q07864	2286 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	POLQ	O75417	2590 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261		E7ESA3	106 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	CFLAR	O15519	480 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC22	O60826	627 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	GRP	P07492	148 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	COX6A1	P12074	109 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ARNT	P27540	789 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SSTR1	P30872	391 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	CRAT	P43155	626 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR143	P51810	404 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	XK	P51811	444 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF273	Q14593	569 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZIC1	Q15915	447 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.4	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261		C9JVG2	144 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	TGFB1	P01137	390 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FPR1	P21462	350 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	MSX1	P28360	303 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	P2RY4	P51582	365 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	CLDN8	P56748	225 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	HYAL2	Q12891	473 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB31	Q13636	194 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KRIT1-222	ENST00000486261	RGS5	O15539	181 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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