RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CD1CP29017 333 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 FASLGP48023 281 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 AP3S2P59780 193 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 ELOCQ15369 112 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 TCTE1Q5JU00 501 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 FGD2Q7Z6J4 655 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 BEST4Q8NFU0 473 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 LIPHQ8WWY8 451 aa16.69■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 C20orf85Q9H1P6 137 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.69■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 Q499Y3 187 aa16.68■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 ZFP64Q9NPA5 681 aa16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.68■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 CEP290O15078 2479 aa16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.68■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 HIST1H2ABP04908 130 aa16.68■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.68■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.67■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC37A1P57057 533 aa16.67■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 OR2T4Q8NH00 348 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.67■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.67■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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SYNE4-204ENST00000465425 GPR171O14626 319 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 PEX14O75381 377 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 KRT33AO76009 404 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 SYPP08247 313 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT1P36639 197 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 GFERP55789 205 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 LCN6P62502 163 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 EGR4Q05215 589 aa16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SYNE4-204ENST00000465425 LYPD8Q6UX82 237 aa16.67■□□□□ 0.26
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