RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IMPAD1Q9NX62 359 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL20Q9NYY1 176 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATMQ13315 3056 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP24Q9UPU5 2620 aa9.18□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A6NIZ1 184 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M0R3G1 203 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IDH3BO43837 385 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNAP29O95721 258 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMGN1P05114 100 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD14P08571 375 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NR2C1P13056 603 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACVR2AP27037 513 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AQP4P55087 323 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PER3P56645 1201 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTXN1P60606 82 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAP1BP61224 184 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAP1AP62834 184 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LTBQ06643 244 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZP4Q12836 540 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2A2Q6IF42 318 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PXKQ7Z7A4 578 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SETD9Q8NE22 299 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF128Q8TEB7 428 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UCN2Q96RP3 112 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APOL4Q9BPW4 351 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CALHM2Q9HA72 323 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLRX2Q9NS18 164 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPTA1P02549 2419 aa9.17□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FREM3P0C091 2139 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MPDZO75970 2070 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF726A6NNF4 738 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0YAE9 185 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYTIPO60759 359 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTP4A3O75365 173 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP1R3DO95685 299 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCL10O95999 233 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 F13BP05160 661 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF3P17036 446 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SDHAP31040 664 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRK5P34947 590 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAPGP40121 348 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3F3AP84243 136 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYBPC1Q00872 1141 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GINS1Q14691 196 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDK3Q15120 406 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POU4F3Q15319 338 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGGHGQ32M88 737 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EMC4Q5J8M3 183 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATCAYQ86WG3 371 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF18BQ86Y91 864 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC103Q8IW40 242 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADI1Q9BV57 179 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GP6Q9HCN6 339 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.16□□□□□ -0.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms