RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 NEUROG1Q92886 237 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FAM162AQ96A26 154 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 APH1AQ96BI3 265 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PYURFQ96I23 114 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 DHRS1Q96LJ7 313 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PRRC1Q96M27 445 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MUS81Q96NY9 551 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OXGR1Q96P68 337 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR2M2Q96R28 347 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 GPA33Q99795 319 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 EMC6Q9BV81 110 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR10A4Q9H209 315 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FKRPQ9H9S5 495 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FANCFQ9NPI8 374 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MED29Q9NX70 200 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MALT1Q9UDY8 824 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 BAG5Q9UL15 447 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RASD1Q9Y272 281 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 V9GYQ6 96 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ZFHX3Q15911 3703 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MED13LQ71F56 2210 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SLC35F4A4IF30 521 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR5H1A6NKK0 313 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 C11orf98E9PRG8 122 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IMPA2O14732 288 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ACOT8O14734 319 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 GSTA4O15217 222 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PTP4A3O75365 173 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RAD51DO75771 328 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 VAMP5O95183 116 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MT-ATP6P00846 226 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IGF2P01344 180 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IFNW1P05000 195 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 F13BP05160 661 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 THRBP10828 461 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IFNGR1P15260 489 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF43P17038 809 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CALB2P22676 271 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MPGP29372 298 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PEX19P40855 299 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 AQP2P41181 271 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 GPR4P46093 362 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OMPP47874 163 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LIMS1P48059 325 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IST1P53990 364 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PRKCDQ05655 676 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PUDPQ08623 228 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SPOCK1Q08629 439 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 BNIP1Q12981 228 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PMS2P3Q13401 168 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CAMK2DQ13557 499 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MELKQ14680 651 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TRAM2Q15035 370 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 P2RY6Q15077 328 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CARD17Q5XLA6 110 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LCN8Q6JVE9 175 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LRFN4Q6PJG9 635 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 C16orf89Q6UX73 402 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CYP2R1Q6VVX0 501 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FKBP9P1Q75LS8 142 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PXKQ7Z7A4 578 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms