RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 LHX2P50458 406 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLLT10P55197 1068 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN15P56746 228 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD13AQ14CX5 517 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRSS48Q7RTY5 328 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYDGFQ969H8 173 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R5Q9NYW4 299 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCIDASD6RGH6 385 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PMS2P2O95744 297 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRPS1P60891 318 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SGCBQ16585 318 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEDAGQ5VYS4 303 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR141Q7Z602 305 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXD3Q8N9H8 876 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNPLA2Q96AD5 504 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRR1Q96L50 414 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIGLEC11Q96RL6 698 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR52Q9Y2T5 361 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CORINQ9Y5Q5 1042 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF407Q9C0G0 2248 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 BHLHE40O14503 412 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMGN1P05114 100 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCMT1P22061 227 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHA8Q96JA3 519 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFT27Q9BW83 186 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLPP3O14495 311 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHG3P01860 377 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 F13BP05160 661 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADORA3P0DMS8 318 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL4P36578 427 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB39AQ14964 217 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKDD1AQ495B1 522 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALG10Q5BKT4 473 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIAH3Q8IW03 269 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRG7Q96K78 797 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPRR3Q9UBC9 169 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFCAB10A6NFE3 127 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 C11orf98E9PRG8 122 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 FZD7O75084 574 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK1P06493 297 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK2P20151 261 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC6A6P31641 620 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRK5P34947 590 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN18P56856 261 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC35A1P78382 337 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SRYQ05066 204 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 INAQ16352 499 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 HBMQ6B0K9 141 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 VASNQ6EMK4 673 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM8Q8N371 416 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 LNX2Q8N448 690 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM99Q8N816 258 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCAIQ8N9R8 606 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q8NA96 180 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC75AQ8NAA5 344 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHST11Q9NPF2 352 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP1R3DO95685 299 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTL6AO96019 429 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF708P17019 499 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 AHCYP23526 432 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP2K4P45985 399 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC43A2Q8N370 569 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 STX19Q8N4C7 294 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SVOPQ8N4V2 548 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2V1Q8NHB1 315 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBA1CQ9BQE3 449 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 SRXN1Q9BYN0 137 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF814B7Z6K7 855 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 MS4A18H0YCH9 400 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR6A2O95222 327 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC2A10O95528 541 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 FADS2O95864 444 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 STSP08842 583 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC15A1P46059 708 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 CARD18P57730 90 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST3GAL4Q11206 333 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10D3Q8NH80 312 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BSA7 217 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF13O43567 381 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
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